2024年4月4日发(作者:泉怀桃)
高级生物与分子生物学
实验报告
姓名:
学号:
指导老师:
实验一:重组pGEX-X载体的构建及表达
【实验原理】:
1. DNA连接原理:本实验将表达载体和PCR产物X进行双酶切,经琼
脂糖凝胶后,割胶分离纯化的目的基因和线性化质粒,用T
4
DNA
连接酶连接表达融合蛋白的重组质粒。
2. 大肠杆菌感受态细胞的制备及转化的原理:经氯化钙处理的大肠
杆菌,受短暂的热刺激后,可形成易于接受环状质粒DNA的感受
态细胞。由于不同的质粒可带有不同的抗生素抗性基因(本实验
质粒带有卡那霉素抗性基因),根据转化菌的耐药特性进行删选。
3. 裂解法小量制备质粒DNA的原理
:
SDS和NaOH使蛋白质和染色体
DNA变性;醋酸盐使变性蛋白、染色体DNA及SDS沉淀,质粒DNA
存在于上清液中;乙醇可使质粒DNA沉淀,酚、氯仿去除残留的
蛋白质。
4. 重组质粒鉴定的原理:对所有的重组质粒用限制性内切酶酶切,
酶切产物行凝胶电泳以鉴定质粒DNA。
5. 组质粒的诱导表达的原理:Ptac启动子受lac阻遏物所调控,该
启动子需要加入异丙基硫代半乳糖苷(IPTP)进行诱导。IPTP的终
浓度为1mmol/L。
6. 融合蛋白的表达检测的原理
:
经诱导表达的重组体裂解后,经
SDS-PAGE鉴定。染色后明显出现目的蛋白带,而未经诱导的菌无
此蛋白带。
【实验步骤】:
1.配制LB和LK培养基
2.连接:质粒片断+目的基因 (1.5ml离心管),16℃水浴过夜,65℃
水浴10min,灭火连接酶。
ddH2O 12ul
X-DNA(目的基因) 3ul
pET-28a(质粒片断) 2ul
10×buffer 2ul
T4 ligase 1ul
3.复苏DH5a和BL21,并接种DH5a 1支,接种BL21 1支(10ul菌液
+2ml LB)于试管,第二天7:30分别转接DH5a和BL21
(1ml+20mlLB)于烧瓶。(分别准备制备感受态,两个连接反应用
来转化)
5a和BL21感受态细胞的制备: 在烧瓶孵育2.5h后,取1.5ml
菌液至1.5ml离心管,4000rmp,5min,弃上清,加500ul 100mmol/l
CaCl
2
,混匀,离心4000rmp,5min,弃上清,加500ul 100mmol/l
CaCl
2
,混匀,冰浴30min,离心(4℃,4000rmp,5min),弃上
清。加100ul 100mmol/l CaCl
2
,重新悬浮沉淀。
5.转化:另取1.5ml离心管,加连接反应液20ul,再加50ul DH5a
和BL21感受态细菌,混匀,冰浴30min。42℃水浴90s,再冰浴
1-2min。加500ulLB,37℃摇床培养1h。5000rpm, 离心3分钟
倒上清,重悬沉淀。
6.涂板,37度过夜培养(DH5α:感受态一块LB,感受态一块LK 转
化菌一块LK, BL21同样)
7.检查细菌生长情况,只有转化菌才能在含卡那霉素的培养基生长
密集生长
无细菌生长
均匀分布
8.质粒提取-碱裂解法
9.质粒酶切反应:在1.5ml离心管中加入以下物质,充分混匀后,瞬
时离心,37度保温1-2小时
ddH2O
10buffer
质粒
BamH I
Xho I
Total
单酶切(ul)
14
2ul
3ul
1
/
20
双酶切(ul)
13
2
3
1
1
20
10.琼脂糖凝胶电泳:溶胶(用TAE缓冲液,充分融化),稍冷却后
倒胶,加样(样品要加样品缓冲液至1),电泳(1-10V/CM),染色
与观察拍照。
11.蛋白诱导表达:(BL21)
-PAGE过程
①配胶
②样品制备
③加样
④电泳(200V)
⑤染色:考马斯亮蓝染色或银染
【实验结果】:
重组质粒的鉴定
空 双 单 质 M 双 单 质
融合蛋白的表达检测
0h 1h 3h 0h 1h 3h
【实验分析】:
⑴ 在重组质粒酶切鉴定图谱中,第一加样泳道为DNA marker, 接下
来的三泳道依次为:没有经过酶切的重组质粒加样泳道,双酶切的重
组质粒加样泳道,单酶切的重组质粒加样泳道。经过分析,经单酶切
的重组质粒两片段的分子量大小分别符合载体pET28a(+)和目的基
因X的大小,即重组质粒构建基本成功。但是,每一泳道都有拖尾,
这可能是酶切时间过短,使酶切不彻底,也可能是限制性内切酶活性
不高,未放于冰上,使其酶切效果不佳。也有可能是胶制作不理想或
者电解液不纯所造成。总之,能引起跑胶拖尾的原因很多,必须每一
步都正规操作,尽量防止这种情况的出现。
⑵在不同时间间隔IPTG诱导重组质粒表达蛋白图中,从左边起的第
一至第三泳道分别是时间间隔为0h,1h,2h重组质粒经异丙基硫代半
乳糖苷(IPTP)诱导在BL-21细胞中蛋白表达后用考马斯亮蓝染色的
图示,可以看出蛋白表达量依次增多。
实验二:脲酶的分离纯化及比活性测定
【实验仪器、试剂】:
仪器:
层析柱ч1.2cm×20cm 恒温水浴箱 751或者752紫外分光光度计
721分光度计
试剂:
1、3%尿素
2、0.1mol/L pH6.8的磷酸盐缓冲液
3、1mol/L HCl
4、32%丙酮溶液
5、纳氏试剂
6、0.001mol/L标准硫酸铵溶液
【实验原理】:
蛋白质(酶)是非常重要的生物大分子,其性质差异很大。蛋
白质的分离和提纯工作室一项艰巨而又复杂的任务。到目前为止,还
没有一个单独的或一套现成的方法能把任何一种蛋白质从复杂的混
合物中提取出来,但对于任何一种蛋白质都可能选择一套适当的分离
提纯程序来获取高纯度的制品
脲酶分子量较大,达490kD。当脲酶粗制品通过交联葡聚糖
SephadexG-200层析柱时,此酶本身不能进入凝胶颗粒的网络内。而
其它小分子物质及分子量较小的蛋白质可扩散进入凝胶颗粒,因此,
用蒸馏水作为洗脱剂,分子量大的脲酶首先被洗脱下来,从而达到与
其他物质分离的目的。定时或定量收集洗脱液,分别在752分光光度
计282nm波长测定其吸光度,再分别测定洗脱峰内各管的酶活性,
以酶活性为纵坐标,以管号为横坐标,会出酶活性曲线,酶活性与蛋
白质洗脱曲线中峰值重叠的部分即为分离所得到的脲酶所在部位。
酶活性测定系根据酶催化尿素水解释出氨和CO
2
作用。
【实验步骤】:
1. 制备脲酶粗提液
2.凝胶过滤层析
①装柱:保持竖直,防分层、干裂
②平衡:装好后用蒸馏水平衡
③加样:加0.6ml粗提液
④洗脱与收集:用蒸馏水洗脱,3ml/15分钟/管,收集12管
3.蛋白质含量检测
4.蛋白质活性检测
【实验结果】:
1. 硫酸铵标准曲线绘制:
管号
1
试剂
0.001M硫酸铵(ml) 0.1 0.2 0.3
0.4 0.6
2.8 2.7
0.4 0.5 0.6 -
0.8 1 1.2 -
2 3 4 5 6 7
含NH3的微克分子数 0.2
H2O(ml) 2.9 2.6 2.5 2.4 3
混 匀
奈氏试剂
A480
0.75ml, 立即混匀
0.548 1.048 1.575 1.834 2.424 2.862 0
硫酸铵标准曲线
4.5
4
3.5
3
2.5
2
1.5
1
0.5
0
-0.5
0
y = 3.2234x - 0.183
R
2
= 0.9534
A
4
8
0
A480
线性 (A480)
0.20.40.60.8
NH3的μmol数
11.21.4
2.蛋白含量测定:
空
白
1 2 3 4 5
洗脱液
6 7 8 9 10 11
粗提液
(1:20稀
12
释)
洗脱液蛋白含量
3.5
3
2.5
2
1.5
1
0.5
0
-0.5
0246
管数
8101214
蛋
白
含
量
(
m
g
/
m
l
)
系列1
3.酶促反应:
洗脱液
空白
1 2 3
粗提液
… 9 10 11 12
(1:20稀
释)
3%尿素0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
(ml)
0.1M PBS 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0
37度保温15分钟
酶液
H2O
-- 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
0.5 -- -- -- -- -- -- -- -- --
混匀,37度保温15分钟
向各管加入1M HCl 0.5ml,放置5分钟,加1M NaOH 0.5ml终止反
应
4. 显色与测定
空
白
1
0.5
洗脱液
2
0.5
3
0.5
4
0.5
5 6 7 8
0.5
9
0.5
10
0.5
11
0.5
粗提液
(1:20稀
12
释
)
上述反应
0.5
液
H2O
奈氏试剂
A480
0.5 0.5 0.5 0.5 0.1
每管加0.75ml,混匀,测量480mm吸光度
5.酶活性计算
空
洗脱液
粗提
白
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
-
液
(1:20
稀释)
A480
NH3(umol)
0 - 0.010.375 4.250 2.682.802 0.215 0.410.130.010.02
4 5 7 6 8 3
0.06
活性/ml
洗脱液
活性/管
[蛋白]
(mg/ml)
(10
-3
)
比活性
[单位:NH3(umol)数/mL[洗脱液·h]
蛋白浓度(mg/ml)=A2800.75
活性/ml洗脱液 = NH3(umol)数3.0/取酶促反应液ml数1/0.560/15
活性/管 =活性/ml洗脱液 3
比活性 =每毫升洗脱液的活性/每毫升洗脱液的蛋白含量
酶活性图
250
200
酶
活
性
150
系列1
100
50
0
0246
管数
8101214
【实验分析】:
由图可知:酶活性与蛋白质洗脱曲线中峰值重叠的部分在第三管
或者第四管,即脲酶所在部位为第三或者第四管。实验过程中,显色
反应是第四管黄色最深最明显,由此可知,第四管的脲酶活性最大。
但是,酶的比活性却是第十一管最高。这可能是酶蛋白含量的差距比
酶活性的差异大的多,所造成的结果。
2024年4月4日发(作者:泉怀桃)
高级生物与分子生物学
实验报告
姓名:
学号:
指导老师:
实验一:重组pGEX-X载体的构建及表达
【实验原理】:
1. DNA连接原理:本实验将表达载体和PCR产物X进行双酶切,经琼
脂糖凝胶后,割胶分离纯化的目的基因和线性化质粒,用T
4
DNA
连接酶连接表达融合蛋白的重组质粒。
2. 大肠杆菌感受态细胞的制备及转化的原理:经氯化钙处理的大肠
杆菌,受短暂的热刺激后,可形成易于接受环状质粒DNA的感受
态细胞。由于不同的质粒可带有不同的抗生素抗性基因(本实验
质粒带有卡那霉素抗性基因),根据转化菌的耐药特性进行删选。
3. 裂解法小量制备质粒DNA的原理
:
SDS和NaOH使蛋白质和染色体
DNA变性;醋酸盐使变性蛋白、染色体DNA及SDS沉淀,质粒DNA
存在于上清液中;乙醇可使质粒DNA沉淀,酚、氯仿去除残留的
蛋白质。
4. 重组质粒鉴定的原理:对所有的重组质粒用限制性内切酶酶切,
酶切产物行凝胶电泳以鉴定质粒DNA。
5. 组质粒的诱导表达的原理:Ptac启动子受lac阻遏物所调控,该
启动子需要加入异丙基硫代半乳糖苷(IPTP)进行诱导。IPTP的终
浓度为1mmol/L。
6. 融合蛋白的表达检测的原理
:
经诱导表达的重组体裂解后,经
SDS-PAGE鉴定。染色后明显出现目的蛋白带,而未经诱导的菌无
此蛋白带。
【实验步骤】:
1.配制LB和LK培养基
2.连接:质粒片断+目的基因 (1.5ml离心管),16℃水浴过夜,65℃
水浴10min,灭火连接酶。
ddH2O 12ul
X-DNA(目的基因) 3ul
pET-28a(质粒片断) 2ul
10×buffer 2ul
T4 ligase 1ul
3.复苏DH5a和BL21,并接种DH5a 1支,接种BL21 1支(10ul菌液
+2ml LB)于试管,第二天7:30分别转接DH5a和BL21
(1ml+20mlLB)于烧瓶。(分别准备制备感受态,两个连接反应用
来转化)
5a和BL21感受态细胞的制备: 在烧瓶孵育2.5h后,取1.5ml
菌液至1.5ml离心管,4000rmp,5min,弃上清,加500ul 100mmol/l
CaCl
2
,混匀,离心4000rmp,5min,弃上清,加500ul 100mmol/l
CaCl
2
,混匀,冰浴30min,离心(4℃,4000rmp,5min),弃上
清。加100ul 100mmol/l CaCl
2
,重新悬浮沉淀。
5.转化:另取1.5ml离心管,加连接反应液20ul,再加50ul DH5a
和BL21感受态细菌,混匀,冰浴30min。42℃水浴90s,再冰浴
1-2min。加500ulLB,37℃摇床培养1h。5000rpm, 离心3分钟
倒上清,重悬沉淀。
6.涂板,37度过夜培养(DH5α:感受态一块LB,感受态一块LK 转
化菌一块LK, BL21同样)
7.检查细菌生长情况,只有转化菌才能在含卡那霉素的培养基生长
密集生长
无细菌生长
均匀分布
8.质粒提取-碱裂解法
9.质粒酶切反应:在1.5ml离心管中加入以下物质,充分混匀后,瞬
时离心,37度保温1-2小时
ddH2O
10buffer
质粒
BamH I
Xho I
Total
单酶切(ul)
14
2ul
3ul
1
/
20
双酶切(ul)
13
2
3
1
1
20
10.琼脂糖凝胶电泳:溶胶(用TAE缓冲液,充分融化),稍冷却后
倒胶,加样(样品要加样品缓冲液至1),电泳(1-10V/CM),染色
与观察拍照。
11.蛋白诱导表达:(BL21)
-PAGE过程
①配胶
②样品制备
③加样
④电泳(200V)
⑤染色:考马斯亮蓝染色或银染
【实验结果】:
重组质粒的鉴定
空 双 单 质 M 双 单 质
融合蛋白的表达检测
0h 1h 3h 0h 1h 3h
【实验分析】:
⑴ 在重组质粒酶切鉴定图谱中,第一加样泳道为DNA marker, 接下
来的三泳道依次为:没有经过酶切的重组质粒加样泳道,双酶切的重
组质粒加样泳道,单酶切的重组质粒加样泳道。经过分析,经单酶切
的重组质粒两片段的分子量大小分别符合载体pET28a(+)和目的基
因X的大小,即重组质粒构建基本成功。但是,每一泳道都有拖尾,
这可能是酶切时间过短,使酶切不彻底,也可能是限制性内切酶活性
不高,未放于冰上,使其酶切效果不佳。也有可能是胶制作不理想或
者电解液不纯所造成。总之,能引起跑胶拖尾的原因很多,必须每一
步都正规操作,尽量防止这种情况的出现。
⑵在不同时间间隔IPTG诱导重组质粒表达蛋白图中,从左边起的第
一至第三泳道分别是时间间隔为0h,1h,2h重组质粒经异丙基硫代半
乳糖苷(IPTP)诱导在BL-21细胞中蛋白表达后用考马斯亮蓝染色的
图示,可以看出蛋白表达量依次增多。
实验二:脲酶的分离纯化及比活性测定
【实验仪器、试剂】:
仪器:
层析柱ч1.2cm×20cm 恒温水浴箱 751或者752紫外分光光度计
721分光度计
试剂:
1、3%尿素
2、0.1mol/L pH6.8的磷酸盐缓冲液
3、1mol/L HCl
4、32%丙酮溶液
5、纳氏试剂
6、0.001mol/L标准硫酸铵溶液
【实验原理】:
蛋白质(酶)是非常重要的生物大分子,其性质差异很大。蛋
白质的分离和提纯工作室一项艰巨而又复杂的任务。到目前为止,还
没有一个单独的或一套现成的方法能把任何一种蛋白质从复杂的混
合物中提取出来,但对于任何一种蛋白质都可能选择一套适当的分离
提纯程序来获取高纯度的制品
脲酶分子量较大,达490kD。当脲酶粗制品通过交联葡聚糖
SephadexG-200层析柱时,此酶本身不能进入凝胶颗粒的网络内。而
其它小分子物质及分子量较小的蛋白质可扩散进入凝胶颗粒,因此,
用蒸馏水作为洗脱剂,分子量大的脲酶首先被洗脱下来,从而达到与
其他物质分离的目的。定时或定量收集洗脱液,分别在752分光光度
计282nm波长测定其吸光度,再分别测定洗脱峰内各管的酶活性,
以酶活性为纵坐标,以管号为横坐标,会出酶活性曲线,酶活性与蛋
白质洗脱曲线中峰值重叠的部分即为分离所得到的脲酶所在部位。
酶活性测定系根据酶催化尿素水解释出氨和CO
2
作用。
【实验步骤】:
1. 制备脲酶粗提液
2.凝胶过滤层析
①装柱:保持竖直,防分层、干裂
②平衡:装好后用蒸馏水平衡
③加样:加0.6ml粗提液
④洗脱与收集:用蒸馏水洗脱,3ml/15分钟/管,收集12管
3.蛋白质含量检测
4.蛋白质活性检测
【实验结果】:
1. 硫酸铵标准曲线绘制:
管号
1
试剂
0.001M硫酸铵(ml) 0.1 0.2 0.3
0.4 0.6
2.8 2.7
0.4 0.5 0.6 -
0.8 1 1.2 -
2 3 4 5 6 7
含NH3的微克分子数 0.2
H2O(ml) 2.9 2.6 2.5 2.4 3
混 匀
奈氏试剂
A480
0.75ml, 立即混匀
0.548 1.048 1.575 1.834 2.424 2.862 0
硫酸铵标准曲线
4.5
4
3.5
3
2.5
2
1.5
1
0.5
0
-0.5
0
y = 3.2234x - 0.183
R
2
= 0.9534
A
4
8
0
A480
线性 (A480)
0.20.40.60.8
NH3的μmol数
11.21.4
2.蛋白含量测定:
空
白
1 2 3 4 5
洗脱液
6 7 8 9 10 11
粗提液
(1:20稀
12
释)
洗脱液蛋白含量
3.5
3
2.5
2
1.5
1
0.5
0
-0.5
0246
管数
8101214
蛋
白
含
量
(
m
g
/
m
l
)
系列1
3.酶促反应:
洗脱液
空白
1 2 3
粗提液
… 9 10 11 12
(1:20稀
释)
3%尿素0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
(ml)
0.1M PBS 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0
37度保温15分钟
酶液
H2O
-- 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
0.5 -- -- -- -- -- -- -- -- --
混匀,37度保温15分钟
向各管加入1M HCl 0.5ml,放置5分钟,加1M NaOH 0.5ml终止反
应
4. 显色与测定
空
白
1
0.5
洗脱液
2
0.5
3
0.5
4
0.5
5 6 7 8
0.5
9
0.5
10
0.5
11
0.5
粗提液
(1:20稀
12
释
)
上述反应
0.5
液
H2O
奈氏试剂
A480
0.5 0.5 0.5 0.5 0.1
每管加0.75ml,混匀,测量480mm吸光度
5.酶活性计算
空
洗脱液
粗提
白
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
-
液
(1:20
稀释)
A480
NH3(umol)
0 - 0.010.375 4.250 2.682.802 0.215 0.410.130.010.02
4 5 7 6 8 3
0.06
活性/ml
洗脱液
活性/管
[蛋白]
(mg/ml)
(10
-3
)
比活性
[单位:NH3(umol)数/mL[洗脱液·h]
蛋白浓度(mg/ml)=A2800.75
活性/ml洗脱液 = NH3(umol)数3.0/取酶促反应液ml数1/0.560/15
活性/管 =活性/ml洗脱液 3
比活性 =每毫升洗脱液的活性/每毫升洗脱液的蛋白含量
酶活性图
250
200
酶
活
性
150
系列1
100
50
0
0246
管数
8101214
【实验分析】:
由图可知:酶活性与蛋白质洗脱曲线中峰值重叠的部分在第三管
或者第四管,即脲酶所在部位为第三或者第四管。实验过程中,显色
反应是第四管黄色最深最明显,由此可知,第四管的脲酶活性最大。
但是,酶的比活性却是第十一管最高。这可能是酶蛋白含量的差距比
酶活性的差异大的多,所造成的结果。